Η συνύπαρξη όλων αυτών των σημαντικών οικοσυστημάτων στην σχετικά περιορισμένη γεωγραφική ενότητα Θράκης, την καθιστά μία περιοχή εξαιρετικής οικολογικής αξίας. Εδώ συναντάει κανείς δασοσκεπείς πλαγιές, μία μοναδική διαδοχή όλων των ζωνών βλάστησης της Ευρώπης στην οροσειρά της Κεντρικής Ροδόπης, τη μοναδική περιοχή στην Ελλάδα όπου ευδοκιμεί φυσικά η δασική και η βαλκανική πεύκη, το μοναδικό παρθένο δάσος της Ελλάδας στο Φρακτό, αλλά και το δάσος Κοτζά Ορμάν, το μεγαλύτερο φυσικό παρόχθιο δάσος της χώρας. Ακόμα, μοναδικούς σε έκταση και βιοποικιλότητα υγροτόπους και διεθνούς σημασίας βιότοπους που προστατεύονται με διεθνείς και ευρωπαϊκές συνθήκες.

Όλα αυτά δεν θα μπορούσε να μην έχουν υπαχθεί σε ένα εθνικό καθεστώς προστασίας. Έτσι, εκτός από τις 27 περιοχές του Δικτύου Natura 2000 στη Θράκη και τους υγροτόπους της Συνθήκης Ramsar, η Θράκη φιλοξενεί και τέσσερα Εθνικά Πάρκα: Το Ε.Π. Αν. Μακεδονίας – Θράκης, το οποίο περιλαμβάνει το Δέλτα του Νέστου, τη Βιστωνίδα και την Ισμαρίδας, το Ε.Π. Οροσειράς Ροδόπης, το Ε.Π. Δάσους Δαδιάς – Λευκίμης – Σουφλίου και το Ε.Π. Δέλτα Έβρου. Συγκεντρωτικές πληροφορίες για τα είδη που συναντάμε μέσα στα Εθνικά Πάρκα αντλήσαμε από διάφορες πηγές, αλλά κυρίως από τους ιστότοπους των Φορέων Διαχείρισης των πάρκων.